در زمان تولّد قائن، حضرت «حوّاء» می‌گوید «مردی حاصل نمودم» به همین دلیل قائن (حاصل‌شده) نام گرفت. واژۀ «قائن» شاید به معنای «آهنگر« ، «نی» یا «نیزه» باشد. به نظر می‌رسد نام او به یکی از خدایان شمال عربستان باستان پیوند دارد و در کتیبه‌های آن منطقه، نام‌هایی چون «عبد قائن» نیز دیده شده‌است.
